地域により、医療費助成の制度が異なり、小児がんの助成の申請方法にも慣れていないので教えてほしい

自治体によっては小児がんの助成を使わなくても、もともと医療費が無料になる地域もあります。また所得制限があることもあります。ただ、小児がんの窓口負担を無料にする場合は、そのクリニックごとに申請しなくてはなりません。またある程度時間がかかりますので、最初は患者さんにご負担いただき、後から遡及で払い戻しということになると思われます。